Po nadobudnutí právoplatnosti rozsudku je odsúdený písomne vyzvaný na nástup do výkonu trestu v určenom termíne. V prípade, že odsúdený na nástup nenastúpi dobrovoľne, môže byť do ústavu predvedený príslušníkmi Policajného zboru. Nástup do výkonu trestu predstavuje pre odsúdeného významnú a často psychicky náročnú životnú situáciu.
Pri nástupe do ústavu prechádza odsúdený vstupnou administratívou, ktorá zahŕňa overenie totožnosti, evidenciu osobných vecí a oboznámenie s vnútorným poriadkom ústavu. Súčasťou nástupu je aj zdravotná prehliadka. Na základe viacerých kritérií je odsúdený zaradený do príslušného typu ústavu a stupňa stráženia.
Po nástupe je odsúdený začlenený do denného režimu ústavu, ktorý zahŕňa pracovné, vzdelávacie a voľnočasové aktivity. Odsúdeným sú zabezpečené primerané životné podmienky, strava, zdravotná starostlivosť a základná psychologická pomoc.